MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli B str. REL606 chromosome

Total Repeats: 94781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012967	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012967	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012967	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012967	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012967	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012967	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254160124
7	NC_012967	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254160124
8	NC_012967	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012967	T	8	8	302	309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012967	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012967	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160125
12	NC_012967	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	254160125
13	NC_012967	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	254160125
14	NC_012967	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	254160125
15	NC_012967	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160125
16	NC_012967	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
17	NC_012967	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	254160125
18	NC_012967	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160125
19	NC_012967	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160125
20	NC_012967	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254160125
21	NC_012967	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	254160125
22	NC_012967	GC	3	6	753	758	0 %	0 %	50 %	50 %	254160125
23	NC_012967	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160125
24	NC_012967	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160125
25	NC_012967	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160125
26	NC_012967	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160125
27	NC_012967	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160125
28	NC_012967	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160125
29	NC_012967	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	254160125
30	NC_012967	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254160125
31	NC_012967	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	254160125
32	NC_012967	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254160125
33	NC_012967	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254160125
34	NC_012967	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
35	NC_012967	AAT	2	6	1272	1277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254160125
36	NC_012967	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160125
37	NC_012967	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	254160125
38	NC_012967	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160125
39	NC_012967	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160125
40	NC_012967	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	254160125
41	NC_012967	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160125
42	NC_012967	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160125
43	NC_012967	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254160125
44	NC_012967	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
45	NC_012967	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160125
46	NC_012967	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160125
47	NC_012967	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254160125
48	NC_012967	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	254160125
49	NC_012967	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160125
50	NC_012967	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160125
51	NC_012967	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254160125
52	NC_012967	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	254160125
53	NC_012967	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254160125
54	NC_012967	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160125
55	NC_012967	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160125
56	NC_012967	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160125
57	NC_012967	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
58	NC_012967	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
59	NC_012967	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160125
60	NC_012967	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
61	NC_012967	ATTGAA	2	12	2430	2441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	254160125
62	NC_012967	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160125
63	NC_012967	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160125
64	NC_012967	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	254160125
65	NC_012967	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
66	NC_012967	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
67	NC_012967	TGCC	2	8	2594	2601	0 %	25 %	25 %	50 %	254160125
68	NC_012967	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254160125
69	NC_012967	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160125
70	NC_012967	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160126
71	NC_012967	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160126
72	NC_012967	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254160126
73	NC_012967	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	254160126
74	NC_012967	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160126
75	NC_012967	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	254160126
76	NC_012967	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160126
77	NC_012967	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160126
78	NC_012967	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160126
79	NC_012967	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160126
80	NC_012967	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160126
81	NC_012967	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	254160126
82	NC_012967	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160126
83	NC_012967	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160126
84	NC_012967	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	254160126
85	NC_012967	CTGG	2	8	3418	3425	0 %	25 %	50 %	25 %	254160126
86	NC_012967	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	254160126
87	NC_012967	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160126
88	NC_012967	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	254160126
89	NC_012967	TCCGGC	2	12	3577	3588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254160126
90	NC_012967	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	254160126
91	NC_012967	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160126
92	NC_012967	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	254160127
93	NC_012967	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	254160127
94	NC_012967	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160127
95	NC_012967	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160127
96	NC_012967	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	254160127
97	NC_012967	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160127
98	NC_012967	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160127
99	NC_012967	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160127
100	NC_012967	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160127
101	NC_012967	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	254160127
102	NC_012967	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160127
103	NC_012967	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160127
104	NC_012967	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160127
105	NC_012967	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160127
106	NC_012967	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254160127
107	NC_012967	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254160127
108	NC_012967	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160127
109	NC_012967	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160127
110	NC_012967	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	254160127
111	NC_012967	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160127
112	NC_012967	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160127
113	NC_012967	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160127
114	NC_012967	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160127
115	NC_012967	T	6	6	5069	5074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012967	GAA	2	6	5077	5082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012967	AAC	2	6	5161	5166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012967	CGT	2	6	5167	5172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012967	GCA	2	6	5289	5294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160128
120	NC_012967	TGG	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160128
121	NC_012967	ACA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254160128
122	NC_012967	CCG	2	6	5448	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160128
123	NC_012967	CCG	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160128
124	NC_012967	CCA	2	6	5465	5470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254160128
125	NC_012967	CTC	2	6	5479	5484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254160128
126	NC_012967	ATC	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160128
127	NC_012967	CGG	2	6	5495	5500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160128
128	NC_012967	AT	3	6	5611	5616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012967	CGC	2	6	5655	5660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_012967	GCT	2	6	5686	5691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160129
131	NC_012967	GGA	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254160129
132	NC_012967	TCA	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160129
133	NC_012967	AAG	2	6	5739	5744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160129
134	NC_012967	CAGT	2	8	5764	5771	25 %	25 %	25 %	25 %	254160129
135	NC_012967	AAT	2	6	5798	5803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254160129
136	NC_012967	TCA	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160129
137	NC_012967	TTC	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254160129
138	NC_012967	TTC	2	6	5910	5915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254160129
139	NC_012967	CAC	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254160129
140	NC_012967	TGC	2	6	5975	5980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160129
141	NC_012967	TTG	2	6	5997	6002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254160129
142	NC_012967	TGA	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160129
143	NC_012967	AAATCG	2	12	6150	6161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254160129
144	NC_012967	AGCG	2	8	6268	6275	25 %	0 %	50 %	25 %	254160129
145	NC_012967	CTG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160129
146	NC_012967	GTG	2	6	6399	6404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160129
147	NC_012967	A	7	7	6494	6500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012967	CAT	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160130
149	NC_012967	GGC	2	6	6568	6573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160130
150	NC_012967	GCC	2	6	6758	6763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160130
151	NC_012967	GTT	2	6	6812	6817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254160130
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153	NC_012967	ATC	2	6	7056	7061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160130
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156	NC_012967	CGC	2	6	7202	7207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160130
157	NC_012967	GCC	2	6	7208	7213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160130
158	NC_012967	GCCA	2	8	7225	7232	25 %	0 %	25 %	50 %	254160130
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162	NC_012967	AGA	2	6	7678	7683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160130
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164	NC_012967	CG	3	6	7744	7749	0 %	0 %	50 %	50 %	254160130
165	NC_012967	CAA	2	6	7878	7883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254160130
166	NC_012967	TAA	2	6	7933	7938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254160130
167	NC_012967	A	6	6	7944	7949	100 %	0 %	0 %	0 %	254160130
168	NC_012967	GCAT	2	8	7954	7961	25 %	25 %	25 %	25 %	254160130
169	NC_012967	AAG	2	6	8017	8022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_012967	TA	3	6	8023	8028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_012967	GGCG	2	8	8085	8092	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
172	NC_012967	CGG	2	6	8149	8154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_012967	CGT	2	6	8169	8174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_012967	ATC	2	6	8178	8183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_012967	ACC	2	6	8269	8274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254160131
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177	NC_012967	TC	3	6	8344	8349	0 %	50 %	0 %	50 %	254160131
178	NC_012967	CGCAG	2	10	8358	8367	20 %	0 %	40 %	40 %	254160131
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182	NC_012967	CAG	2	6	8437	8442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160131
183	NC_012967	CGAC	2	8	8453	8460	25 %	0 %	25 %	50 %	254160131
184	NC_012967	TGC	2	6	8658	8663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160131
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196	NC_012967	CTGT	2	8	9238	9245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
197	NC_012967	TGA	2	6	9302	9307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160132
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230	NC_012967	TGC	2	6	10746	10751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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232	NC_012967	TGC	2	6	10809	10814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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241	NC_012967	CATT	2	8	11348	11355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
242	NC_012967	T	6	6	11354	11359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_012967	GTC	2	6	11383	11388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160134
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250	NC_012967	CTG	2	6	11835	11840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_012967	TCTTT	2	10	11866	11875	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
252	NC_012967	TTA	2	6	11876	11881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_012967	T	6	6	11885	11890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_012967	ATTC	2	8	11910	11917	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
255	NC_012967	A	6	6	11990	11995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_012967	TGA	2	6	12013	12018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_012967	TAG	2	6	12038	12043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_012967	AGTG	2	8	12052	12059	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
259	NC_012967	A	7	7	12067	12073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_012967	ATG	2	6	12129	12134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_012967	AT	3	6	12140	12145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_012967	AAT	2	6	12169	12174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254160135
263	NC_012967	TAC	2	6	12190	12195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160135
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265	NC_012967	CAC	2	6	12223	12228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254160135
266	NC_012967	CAC	2	6	12262	12267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254160135
267	NC_012967	TGGT	2	8	12306	12313	0 %	50 %	50 %	0 %	254160135
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269	NC_012967	GAA	2	6	12398	12403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160135
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398	NC_012967	CTT	2	6	18189	18194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254160140
399	NC_012967	AGCGA	2	10	18228	18237	40 %	0 %	40 %	20 %	254160140
400	NC_012967	GTGG	2	8	18258	18265	0 %	25 %	75 %	0 %	254160140
401	NC_012967	ATC	2	6	18361	18366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160140
402	NC_012967	CTG	2	6	18408	18413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160140
403	NC_012967	CGG	2	6	18602	18607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160140
404	NC_012967	CGTT	2	8	18630	18637	0 %	50 %	25 %	25 %	254160140
405	NC_012967	GA	3	6	18707	18712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
406	NC_012967	AAG	2	6	18769	18774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160141
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481	NC_012967	ATT	2	6	22051	22056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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